通过AI与人类的合作实现iPS细胞技术的社会化应用
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AI×iPS细胞让“无疾善终”变成现实?
每个人都可以不受疾病困扰,在健康状态下走完一生——这样的未来正在一点一点地向我们靠近。比如,使用智能手表等可穿戴设备常时记录心跳、睡眠等数据,通过AI分析来预测风险,这样便能在出现症状前调整生活习惯或采取医疗措施,从而能更加容易地维持健康状态。另一方面,也有一些仅靠预防和管理难以避免的疾病或损伤。作为“最后一道防线”被人们寄予厚望的,正是基于iPS细胞(诱导性多能干细胞)的再生医疗技术。
iPS细胞是在皮肤或血液等体细胞内导入特定基因使其初始化,回归到可以分化为多种细胞状态的一种细胞。2006年,京都大学山中伸弥教授在小白鼠身上成功培育出iPS细胞,今年正好是第20个年头。着眼于利用iPS技术恢复因疾病或损伤而丧失的身体机能这种医疗技术的商业化,全球各地的研究人员和制药企业展开了激烈竞争。
川上教授常年致力于通过AI和机器学习等数理科学手法开展的医学研究工作。即使诊断结果相同,但某些药物有的人用了有效,有的人用了没效。同时,一些癌症初期患者数年之后会复发,而有些病例即使被确诊为癌症末期,但也可以存活多年而不复发,川上教授的构想是建立一种根据数据对这些个人差异进行分类,以提供恰当治疗方案的知识体系,而不是单纯依赖医生的经验判断。
川上教授在理化学研究所担任旨在利用AI和医学科学以防病于未然的“预测医学特别项目”的团队总监,身处相关研究的最前沿。
他表示,“我认为能够满足人们健康长寿,不受病痛困扰地安然辞世这样一种所谓‘无疾善终’理想的医疗服务完全有可能成为现实。虽然五年十年之内办不到,但我期待到2050年之前能够逐渐变成现实”。
AI×iPS细胞的现状
利用AI开展的iPS细胞医疗研究工作进展到了什么程度?
开展生命科学领域AI研发业务的Epistra公司(东京都品川区)等机构组成的研究团队于2022年6月发布消息称成功开发出一套“优化”系统,可以借助AI在庞大的数据组合中自动找出iPS细胞等用于再生医疗的细胞的培养条件。
在此之前,细胞培养工作在很大程度上依赖于资深研究人员的经验和感觉,难以高效稳定地制备高质量的细胞。Epistra团队的研究引入了名为“Mahoro”的实验用机器人和名为“Epistra Accelerate”的AI分析软件。AI选出温度和营养投入方式等条件后,机器人按照其指令培养细胞,然后对得到的结果加以分析,决定下一步应该测试的条件——通过不断重复这个过程,可以高效获取高质量的细胞。

培养iPS细胞的“Mahoro”机器人(神户市中央区理化学研究所)(时事社)
川上教授表示,“近年来,在生命科学领域,作为AI核心技术的‘优化技术’开始发挥重要作用。制备iPS细胞所需的‘山中因子(四种关键转录因子)’也是过去在庞大的备选因子中通过实验筛选出来的。用于再生医疗的细胞培养也同样具有这样的‘条件筛选难度’。按照不同顺序导入不同程度的基因或蛋白质等特定因子,会导致用于再生医疗的细胞性质大不相同。以前需要花费大量时间和精力的条件筛选工作,现在已经可以通过AI高效推导了”。
开展再生医疗,需要稳定地制备大量高质量的细胞用来给患者移植。通过AI和机器人的结合,有望消除作业过程中的偏差,节约时间和成本,作为一种推动iPS细胞再生医疗社会化应用的技术备受关注。
川上教授表示,“大约15年前,我曾参与过一个关于流感病毒增殖的研究项目,当时不断重复大量实验,几乎每天消耗100箱一次性吸头,强烈感觉‘这不是应该让人来干的工作’。人的手很难做到长时间保持完全一样的条件,像处理细胞这种细致的操作更是难上加难。在这一点上,机器人可以准确地重复相同动作。无论是机器人还是AI技术,对于iPS细胞医疗来说都是非常有效的”。
这些技术正在让iPS细胞医疗从“工匠技艺”逐渐变成一种“可以再现的技术”。
寻找适合各个患者的治疗方法的“个性化医疗”的进展
近年来,主要通过iPS细胞制备的“类器官(Organoid)”相关研究也取得了重大进展。类器官是直径大约数毫米的三维组织培养物,缩小再现了真实器官的部分结构和功能,被称作“迷你器官”。
由于类器官可以在体外如实重现人体细胞特征,所以常常被用于详细研究疾病发病、发展的“病态模型”研究。同时,也有助于开展“个性化医疗”研究活动,帮助研究人员找到针对疾病的有效药物,或是适合各个患者体质和病状的治疗方法。
具体事例方面,东京科学大学等单位组建的研究团队制作了会造成“肾单位肾痨(Nephronophthisis, NPH)”这种指定疑难肾病的基因缺损肾脏类器官,与正常情况进行比较后发现,和组织变硬的“纤维化”问题相关的分子存在异常。此外,研究团队还发现了可以遏制这种异常的药物,开辟了通往新疗法的道路。
现在人们正在讨论将AI图像分析与全面检测基因和蛋白质等物质的“组学数据分析”相结合,以推动创新药和个性化医疗服务发展的可能性。AI和类器官研究目前正在开始结合。
川上教授正计划与著名的类器官研究先驱人物、大阪大学武部贵则教授一道开展新的研究。他表示,“AI和人类的一大不同在于认知能力。人类可以直观处理的是能够通过视觉理解的简单结构,而AI则可以分析随时间而变化的类器官的复杂三维结构。正因为处于人类无法瞬间掌握的数据处理领域,这样的技术才具有生命力。我认为,将过去依赖于资深人员经验或直觉的判断以具有再现性的形式交给AI去做,创新药和个性化医疗将会不断发展”。
人类继续扮演试错角色
在AI不断融入社会各种领域的背景下,今后人类应该扮演什么样的角色?川上教授认为,
“大家都说AI拥有高度的智能和处理能力,但实际上,只有人类给予其‘方向’和‘问题’才能发挥力量。如果不给任何指令,那么即使让AI自主思考,也不会取得什么好成果。应该追求建成怎样的社会?在这种规划方向的问题上在今后也需要人类发挥重要作用”。
随着ChatGPT等工具的面世,AI已经逐渐走进了人们的日常生活,但至少目前,还没有走到让AI去做目标设定和价值判断的阶段。在这样的背景下,另一个必须由人类扮演的角色就浮现了出来。
“AI在决定意义上缺乏的是‘身体性’。由于其没有实体,就无法直接作用于现实世界,也无法通过自身来感受结果。即使AI可以基于数据做出‘应该会变成这样’之类的预测,但其无法体验在现实世界中到底产生了怎样的结果,也无法在失败基础上重新来过。我认为,实际动手对环境造成影响,确认其变化,如此反复试错的角色,还是需要让人类来继续扮演。”
就像这样,人类提出问题,在现实世界负责判断和实践,AI则负责处理庞大的数据和复杂的预测工作。随着这种合作关系不断加深,未来的人们必定可以在健康状态下走过一生,活出自我直至生命最后一刻,而不是得了病再治疗。
采访/撰文:杉原由花、大越裕(理科撰稿人团队PASCAL)
编辑支持:株式会社POWER NEWS
标题图片/文内图片:横关一浩(Mahoro机器人除外)
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