船舶由臺灣調度？
宜蘭縣蘇澳鎮，同樣是位於花蓮所在的臺灣東部，和與那國町同屬八重山地區的石垣市締結姊妹市關係。蘇澳鎮的蘇澳港（南方澳漁港）不只在地理上接近，以日本統治時期為中心，在歷史上與臺灣也有相當深厚的淵源。
臺灣東部有花蓮、宜蘭和台東三縣，又被稱為「後山」。後山的地方首長及相關人士在5月3日成立了「與那國島直航大聯盟」，高舉「國境與國境攜手合作，創造新的核心價值」的理念，希望同為遠離中央的後山地區能共同攜手合作，能夠找出新的價值。
前花蓮市長魏木村也很熟悉與那國島的情況，曾說道：「與那國島居民生病住院的話，必須要到石垣島，非常不方便」，而「（臺灣）在生活、經濟和醫療上能夠提供協助」，強調航路開通的意義。
另一方面，前蘇澳鎮長林棋山表示：「日本國內的遊客從東京來到石垣、與那國島時，可以再往臺灣延伸」，他注意到石垣島在日本國內是相當受歡迎的旅遊勝地，希望能夠活用直航路線，吸引到更多日本人到臺灣一遊。台東市長或擔任立法委員的賴坤成也展現出積極態度，表示根據到目前為止的調查，「可以確定在蘇澳港或花蓮港的海關・出入境・檢疫（CIQ）的對應是沒有問題的」。
迎接姊妹市30週年的2012年時，花蓮市內舉辦了意見交換會議，會中花蓮方面指出，讓遊客在臺灣與八重山之間可以相互往來是有其必要性的。雖然當時針對航空路線的意見出現分歧，但是有個交通路線可以讓雙方保持往來，這個看法到現在仍是一致的。也有人提議，如果從臺灣進口農產品或生活物資的話，就可以抑制與那國島的物價。
在臺灣成立「與那國島直航大聯盟」的成員合影＝2022年5月3日，台北市內
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