早已注定的亂局
而上述提到的歸還普天間,雖然達成了協議,但事至今日,「替代設施」仍是一大難題。關於這一點,在公布達成歸還協議時稱,將在以嘉手納基地為中心的沖繩其他美軍基地內建設直升機機場,並將部分功能轉移到山口縣的岩國基地,從而確保普天間基地原有的功能。但實際上,可以說是並沒有敲定具體內容。此後近20年來,圍繞替代設施的撲朔迷離狀態,就是最好的證明。

關於這一點,橋本龍太郎本人曾說,「在處理這些問題之際,當時比如沒有留更多的時間給防衛廳和駐日美軍上層去進行溝通」,並歸咎於當時部分報紙為搶獨家新聞而洩露了訊息,「我在這一點上非常懊悔。要是有幾天時間……」(引自《朝日新聞》1999年11月11日的報道)
但是,縮小沖繩美軍基地的最大難關是「縣內搬遷」,即遷移地必須在沖繩縣內。有「政策專家」之稱的橋本龍太郎不可能不清楚這一點。比如,靠近那霸市中心的那霸軍港等,早在1974年就達成了歸還協議,但由於縣內搬遷這個前提條件,以致40年過去後的今天,搬遷還依然不見動靜。若要全面將普天間的搬遷地設定在沖繩縣內的話,那就完全不是因「獨家新聞」損失的幾天時間就可解決的問題了。
從這個意義上講,在公布達成協議的那一刻起,普天間歸還就包含著難以兌現的可能性。也可以說之後的亂局在誕生之時就早有注定的一面。但是時任首相橋本龍太郎就是這樣被逼到了走投無路的境地。最終,橋本看中了建造巨型浮體的「海上基地」方案,看似能一舉解決這個矛盾了。但結果是,圍繞海上方案還是陸上方案,又產生了新的混亂。
沖繩與日本本土之間的鴻溝加深
另一方面,大田知事的拒絕代理署名問題上訴到了最高法院。1996年8月,因沖繩縣敗訴,大田轉而答應署名。但大田的妥協,看上去和在那前後日本中央政府提出條件優厚的沖繩振興政策有關,因此沖繩縣內對「金錢交易」的質疑呼聲也很大。被認為是縣內搬遷候選地的名護市,在居民投票中反對派占了大多數,而名護市市長則聲明表示推翻投票結果,導致事態更加複雜。大田知事夾在政府和縣民中間左右為難,再三猶豫之後最終表態反對搬遷,但此時,他已經失去了凝聚民眾的向心力。
之後,在1998年11月的知事選舉中,稻嶺惠一擊敗大田就任新知事。他表示,以「15年」的期限和軍民共用為條件,接受搬遷到邊野古的方案。其後任仲井真弘多知事在任期間,知事和名護市市長等相關地方首長,曾有過一致表示「只能搬遷到邊野古」的時期。政府的外交防務相關人士非常後悔,那時真是「千載難逢的機會」。因為後來民主黨上臺執政,鳩山由紀夫首相提出,「至少也要搬遷到沖繩縣之外」。
政府人士和日本本土輿論大多認為,「如果那時鳩山首相不多嘴就好了……」。可對於沖繩縣人來說,鳩山政府剛一提出要「縣外搬遷」至日本本土,本土各地就露骨地表示抗拒,這種情形更令他們深感震驚。本來日美安保就不是為了沖繩,而是要保衛整個日本的,也是因為這樣的想法,讓沖繩人在感情上承受了難以名狀的衝擊。雖然政府在沖繩做了地緣政治等各種解釋工作,但結果就像安保專家、曾擔任過防衛大臣的森本敏所說的那樣,搬遷地「從軍事上看非沖繩也無妨,但從政治上看還是沖繩最合適」。