於花蓮打造出「賀田村」
「賀田組」在臺灣各地進行物資調度、建築業、運輸業、鐵道建設、港口事業以外，也因為在日俄戰爭中擔任陸海軍的各種調度而獲取巨額利益。之後因接收臺灣總督府回收臺灣東部花蓮至臺東的土地，在當地建造名為「賀田村」的農村，著手經營農場。金三郎之後被視為參與了創立臺灣銀行、臺灣製糖等大企業的臺灣財經界名人一樣成功，就是因為建造了臺灣第一個移民村「賀田村」。
明治31年(1898)2月26日奉命成為第4代臺灣總督的兒玉源太郎得知臺灣東部的開發遲遲沒有進展，就找後藤新平民政長官了解狀況，得到了「雖然困難重重但是發展的可能性很大」、「能實現開發的人非金三郎莫屬」等報告。金三郎不僅因為經營「驛傳社」而獲得總督府的信賴，也曾經幫助後藤長官解決很多難題，與後藤長官構築起深厚的信賴關係。
後藤新平（國立國家圖書館）明治32年(1899)，金三郎依照「官有林野預約賣渡規則」，向臺灣總督府提出臺灣東部地區開發計畫書，同年11月16日總督府就核准開墾。金三郎原先申請臺灣東部開發的總面積為1萬6000平方公里的大平原。總督府在核准開墾的同時並將開墾期間設為最長15年。賀田組隨後利用此廣闊的東臺灣地區用地，除了經營製糖業外，還兼營製樟腦油業、畜牧業、移民事業、運輸業等等，進行多角的開發經營。
明治35年(1902)，賀田組正式開始臺灣東部的開墾。雇用了120名原住民，第一年度開墾了吳全城100公頃月地，隔年更開墾了500公頃，並建立了「賀田村」，接著又開墾鄰接的鯉魚尾庄並設立「壽村」。
在開墾之地種植了甘蔗、菸草、芋頭等植物。另外還將臺灣原生種的甘蔗更改為夏威夷品種，並導入新型的壓榨機使製糖業近代化。但是在「賀田村」順利營運的時期，金三郎最信賴的胞弟也是公司的副社長突然過世。當時金三郎精神上深受打擊，卻將悲憤化為力量專注事業發展，慢慢走出悲傷。
栽培甘蔗成功的賀田組，將新型的製糖工廠設立在「壽村」，開始製造一次性精製粗糖。後來這間工廠被鹽水港製糖股份公司合併，二次大戰後再被臺灣製糖承接。
當時賀田組除了製糖業以外，還經營製樟腦油、酪農業、輕軌鐵道等多種事業的開發。其中就屬製糖業的人手最不足。為了穩定蔗糖、樟腦油的供給和擴大開墾面積，並使東臺灣地區的事業上軌道，怎麼樣都得增加人力才行。
花蓮玉里神社的參道遺址（攝影：野島剛）
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