明治以后，与神道的关系加深

到了明治时代，受到神佛分离、废佛毁释等运动的影响，“神佛习合”消失，今天已经很难再现。在朝廷设于京都时期，宫中曾经存在过一个被称作“御黑户”的佛坛，但随着神佛分离，这个佛坛被迁移到了天皇家族的家庙京都泉涌寺。

进入明治时代后，天皇与神道，或者说天皇与佛教的关系发生了根本性的变化。起初，明治政府为了确立天皇亲政，将神道作为核心思想推进国家建设，导致佛教被彻底清除出了皇室。明治时代，山阶宫晃亲王曾经出家当过寺院住持，希望死后能举行佛教式的葬礼，但未能得到明治政府的同意。

相反，明治2年，年仅16岁的明治天皇参拜了伊势神宫，这是历史上天皇首次参拜该神宫。尽管历代天皇此前从未造访过伊势神宫的原因是一个巨大的谜团，但之后，天皇与神道的关系得到了进一步的强化。当时，沿途的195座寺院都遭到了毁坏。

明治天皇本人是如何看待这种变化的？我们不得而知。当时他年纪尚轻，也可能对宗教和信仰这些东西并没有坚定的想法。至少，把佛教信仰逐出皇室的，是那些试图将神道作为新的日本国家核心思想的国学家和神道家。

明治政府将神道脱离了宗教的范畴。具体来说，就是将最初在内务省内设立的社寺局，分割成了神社局和宗教局，神道受到了不同于佛教和基督教的区别对待。

早在那个时候，大日本帝国宪法就已经制定，信教自由也得到了承认。之所以将神道与其他宗教加以区别，目的在于通过将其置于宗教范畴之外，使之上升为国民道德，把神道礼法强加于全体国民。

天皇扮演着在宫中三殿祭祀皇祖神、皇灵、天神地祇（所有神明）的主祭神官角色。国民祭拜神明，同时也崇拜作为主祭的天皇。这种体制是在明治时代确立的。