空襲砲火下的臺灣總督府

竣工以來，總督府作為權力象徵，君臨臺灣，卻未能倖免於戰禍。針對臺灣地區的空襲始於1944（昭和19）年10月12日，總督府的中央塔受到轟炸，隔年5月31日的臺北大空襲時，建築物的右邊也遭受損壞，雖然此時倒塌的僅有中央塔樓方向的電梯和樓梯，及之間的辦公室，但據說花了3天才將大火撲滅。

當時在建築物內的人們雖然已經前往地下室避難，但全被活埋，釀成了重大的悲劇。在此空襲中，超過百人喪失生命，建築物的83%受到損害。

日本時代拍攝的臺灣總督府（《轉載自老照片訴說臺灣日本統治時期50年　1895～1945》）

戰爭結束後，臺灣由蔣介石率領的中華民國國民黨的統治，臺灣總督府也改名為「臺灣省行政長官公署」。其後，國民黨在內戰中敗給共產黨，於是將國家體制轉移到臺灣，此建築便成為了中華民國的總統府，沿用至今。