票价

主要区间的票价（非繁忙期）

普通车厢（对号座） 商务车厢（Green Car） 特等车厢（专人服务）
东京～新函馆北斗 23430 30940 39320
仙台～新函馆北斗 17950 24410 32790
盛冈～新函馆北斗 13440 17810 26190
新青森～新函馆北斗 7720 9990 15230

单位：日元 ［2019年10月1日消费税增税后更新/特等车厢（专人服务）票价包括了服务费］

使用日本铁路通票（Japan Railway Pass）

持有日本铁路通票的乘客，乘坐北海道新干线所有车次，都无需另补差价。持有商务车厢通票和普通车厢通票的乘客，可持票入座相应车厢。但特等车厢还需另补乘车区段的特快票价和特等车厢差价（例如东京～新函馆北斗，还需补交26720日元）。

随着北海道新干线的通车，连接本州与北海道的“在来线”客车全线停运，因此如果想利用铁路交通往来于津轻海峡两岸，就必须乘坐新干线。此外，北海道地区与新干线并行的部分“在来线”（木古内～五棱郭区间），将从JR独立出去而成为其他公司运营的线路。该区段不能使用日本铁路通票，需另购车票。